随着不断的增殖，王氏大肠杆菌（以后属于王深的细胞都会用王氏区分）已经分裂了将近四千个，在这期间王深也见识了不少其他的微生物，但最多的还是各种大肠杆菌，王深的态度就是一个字，打。

王氏大肠杆菌新增了很多种质粒，其中就有表达性菌毛的质粒，于是王深就用性菌毛将很多有用的质粒分给了大部分的大肠杆菌，主要是一些可以和细胞壁细胞膜结合的结构蛋白，其次是一些可以利用非葡萄糖的消化酶。

在这期间王深也遇到了一些其他的微生物，圆的，杆的，螺旋的，有的比王深的个体要大上几倍，但是因为没有脑子，还是都死在了王深的围剿之下。

王深有试着直接转录翻译这些微生物的dna，但是有的基因组单个大肠杆菌并不能提供全过程的营养物质，而且直接从头读到尾并不能转录出完整的蛋白，更像是一个强行按在一起的聚合体。因为一条dna链往往含有多个基因，由于不能很好的区分操纵子等关键序列，王深的直接进化想法破灭了。

最后王深采用了建立基因库的方法，将一个细胞的的整个基因组分成一小段或者一大段组装到单个质粒中，然后分别存放到不同个体的大肠杆菌中。同时王深仗着自己数量多，采用了最辛苦但是也最有效的方法穷举法，来测试每个分离出来的dna片段起到什么作用。

王深将同一种细胞的基因库大肠杆菌都聚拢在一起进行转录翻译，然后外围包裹着只进行增殖的大肠杆菌，最外围游荡着探索的大肠杆菌，同时中间穿梭着运载有机物的大肠杆菌。乍一看倒有了组织的感觉，或许最初的组织也是一群细胞为了活下去分工协作吧。

功夫不负有心人，在王深不断的翻译下还是发现了一些很有用的单个基因的完整片段，比如一些消化酶，内毒素和外毒素。

王深将其中具有攻击和防护作用的基因都复制到外围的大肠杆菌中，而中间的大肠杆菌则是单纯的进行增殖和基因表达。这样分工协作有利于节省营养物质的消耗。

通过遇到的一些微生物，王深大致可以确定自己处于水体的中下层，因为遇到的微生物大多是厌氧和化能自养的。王深也分离出了一些用于化能自养和厌氧呼吸的酶，但是王深并不打算使用，因为化能自养和厌氧呼吸的生长方式很慢，大肠杆菌可以兼性厌氧呼吸，还是异养生物，生长和增殖要快得多，但是这些酶可以保留以备后用。

王深也遇到了人类的好伙伴乳酸菌和酵母菌，这其实是两个很广泛的范畴，王深只遇到了其中的一部分。对于产乳酸和产乙醇的基因王深很眼馋，所以当仁不让的把它们给噶了，然后将他们的基因建库，进行基因表达筛选。